Genetic variability of cocoa from the amazon basin: implications for genetic conservation

The cocoa and chocolate production chain involves US$60 billion annually and three million farmers around the world, in an area exceeding nine million hectares. The use of wild germplasm will enable to generate new disease- and pest-resistant cultivars and ability to adapt to changing environments. Here we evaluated 145 cocoa accessions, originated from nine Amazonian basins, based on eight fruit traits. Univariate anova showed significant differences (p<0.05) for all traits. For seven traits, the variance component within basins was higher (81.5%, on average). Therefore, it is recommended that the collection of wild accessions prioritize a larger number of plants from a few populations of the most divergent basins. The multivariate analyses revealed a greater divergence between the Ji-Paraná-RO and Solimões/Amazonas-PA basins (27.69) and a greater similarity between Alien clones-PER and Solimões/Amazonas-AM (0.66) in relation to their populations. They also revealed that the accessions differentiation occurred according to the river basin system. These results allowed elucidate the genetic structure and distribution of cacao populations. In addition, strengthen the importance of collecting and conserving germplasm to preserve genetic resources.

Building knowledge to save species: 20 years of ichthyological studies in the Tocantins-Araguaia River basin / Construindo conhecimento para salvar espécies: 20 anos de estudos ictiológicos na bacia do rio Tocantins-Araguaia

Abstract: The Tocantins-Araguaia River basin is the largest basin located entirely in the Brazilian territory. The high degree of endemism of its ichthyofauna has been revealed in several studies, with the upper Tocantins River having the largest absolute number of endemic taxa within the Amazon basin. Here we provide an accurate review of the ichthyofauna of the Tocantins-Araguaia River basin, based on collections made between 2000-2020, including an extensive list of valid fish species occurring in the basin and a discussion of the major threats to its ichthyofauna. Ichthyofauna diversity was further refined based on web searches. Protected Areas and hydropower plants were mapped using shape files or coordinates from the responsible government agencies. 751 species of fishes are currently known from the Tocantins-Araguaia River basin. A considerable increase in fish diversity knowledge occurred in the last 20 years, in parallel with significant anthropic alterations in the basin and its surroundings. Dams constructed along the basin are ranked as the major threats to ichthyofauna. Although the drainage-basin holds several conservation units and indigenous lands, they have not been sufficient to guarantee the preservation of fish species. Our compilation emphasizes that the upper Tocantins River must be considered as a priority area to preserve fish species. Some mitigation actions that may achieve satisfactory results concerning ichthyofauna conservation are proposed.

Resumo: A bacia do rio Tocantins-Araguaia é a maior bacia localizada completamente no território brasileiro. O elevado nível de endemismo de sua ictiofauna foi atestado em vários estudos, com o alto rio Tocantins possuindo o maior número absoluto de táxons endêmicos da bacia Amazônica. Aqui, fornecemos uma acurada revisão sobre o conhecimento da ictiofauna da bacia do rio Tocantins-Araguaia entre 2000-2020; uma extensa lista das espécies válidas de peixes ocorrentes na bacia, assim como uma discussão sobre as maiores ameaças para sua ictiofauna. Dados sobre a diversidade da ictiofauna foram refinados por meio de buscas na internet. O mapeamento das Áreas Protegidas e das hidrelétricas foi realizado utilizando os arquivos de área ou coordenadas fornecidas pelas agências governamentais responsáveis. 751 espécies de peixes são atualmente conhecidas para a bacia do rio Tocantins-Araguaia. Um aumento considerável no conhecimento sobre a diversidade de peixes ocorreu nos últimos 20 anos em paralelo com significativas alterações antrópicas na bacia e seu entorno. As represas ao longo da bacia são consideradas a maior ameaça à ictiofauna. Embora a região hidrográfica abrigue diversas unidades de conservação e terras indígenas, estas não têm sido suficientes para garantir a preservação das espécies de peixes. Nossa compilação enfatiza que o alto rio Tocantins precisa ser considerado como área prioritária para a conservação das espécies de peixes. Algumas ações mitigatórias, que podem atingir resultados satisfatórios em relação à conservação da ictiofauna, são também propostas.

Flood pulse influence on the feeding ecology of two Amazonian auchenipterid catfishes

We assessed the flood pulse effect on the diet composition, trophic niche breadth, and the amount of food intake of two Amazonian auchenipterids with different feeding strategies. Sampling was carried out quarterly (from April/2012 to January/2014) on the middle Xingu River, using gillnets. We measured specimens for standard length and total weight. The specimens' stomachs were removed, weighed, and had their contents identified. We analyzed 360 stomachs of Auchenipterus nuchalis and 584 of Tocantinsia piresi. The diet of A. nuchalis was mainly composed of aquatic insects and crustaceans, while T. piresi fed on fruits and seeds. The diet composition of both species varied seasonally, but only T. piresi changed its trophic niche breadth in response to hydrological changes, becoming more specialist during the higher water periods (filling and flood). Both species also showed differences in their amount of food intake between hydrological periods, with A. nuchalis feeding more intensely in lower water periods (ebb and dry), while T. piresi in the higher water periods. We evidenced different responses to the hydrological periods for the related species. We emphasize that studies considering the relationship between flood pulse and feeding ecology of the organisms are essential to understanding river floodplain systems' dynamics.(AU)

Avaliamos o efeito do pulso de inundação na composição da dieta, amplitude de nicho trófico e quantidade de alimento ingerido de dois auchenipterídeos amazônicos com diferentes estratégias alimentares. Os espécimes foram amostrados trimestralmente entre abril/2012 e janeiro/2014 no médio rio Xingu, utilizando malhadeiras. Estes foram mensurados quanto ao comprimento padrão e peso total. Os estômagos dos espécimes foram removidos, pesados e seu conteúdo identificado. Analisamos 360 estômagos de Auchenipterus nuchalis e 584 de Tocantinsia piresi. A dieta de A. nuchalis foi predominantemente composta por insetos aquáticos e crustáceos, enquanto para T. piresi frutos e sementes predominaram. A composição da dieta de ambas as espécies variou sazonalmente, mas apenas para T. piresi a amplitude de nicho trófico variou entre períodos hidrológicos, sendo mais especialista nos períodos de águas altas (enchente e cheia). Ambas as espécies diferiram na quantidade de alimento ingerido entre os períodos hidrológicos, sendo maior para A. nuchalis nos períodos de águas baixas (vazante e seca) e para T. piresi nos períodos de águas altas. Evidenciamos diferentes respostas à variação hidrológica pelas espécies. Enfatizamos que estudos considerando a relação entre a dinâmica do pulso de inundação e a ecologia alimentar dos organismos é fundamental para um melhor entendimento da dinâmica das planícies de inundação.(AU)

Checklist of freshwater fishes from Loreto, Peru / Lista de especies de peces de agua dulce de Loreto, Perú

Abstract This study presents an extensive review of published and unpublished occurrence records of fish species in the Loreto department. Located in the northeast of the country, Loreto is the most geographically extensive region in the Peruvian territory. Despite the increase in fish collections in Loreto in recent years, the ichthyofauna of this department needs to be more documented. Based on a database of scientific collections and bibliographic information, an updated checklist of the freshwater fishes from Loreto is presented. The results reveal a rich and diversified ichthyofauna, with 873 species distributed in 331 genera, 50 families and 15 orders. The main groups are Characiformes (42.6%), Siluriformes (34.8%), Gymnotiformes (8.6%) and Cichliformes (7.4%). Part of the ichthyofauna has restricted distribution for Loreto (4.7%). In addition, 9.0% of species from Loreto are used in fisheries. Meanwhile, 219 species (25%) were categorized according to the IUCN criteria where only six species (0.7%) are currently considered threatened species (CR, EN or VU). The results presented in this work indicate that this department needs more studies to know the biodiversity of fish, likewise, the information presented constitutes a contribution to the knowledge of fish diversity that would support environmental management actions and decision-making aimed at conserving one of the most diverse departments of Peru.

Resumen Este trabajo presenta una revisión de los registros de especies de peces, publicados y no publicados, del departamento de Loreto. Localizado al noreste del país, Loreto es el departamento más extenso del territorio peruano. A pesar del incremento en el número de las colectas de peces en Loreto en años recientes, la ictiofauna de este departamento necesita ser más documentada. Sustentado en los registros en bases de datos de colecciones científicas e información bibliográfica, se presenta una actualización de la lista de peces de agua dulce de Loreto. Los resultados revelaron una ictiofauna rica y diversificada, con 873 especies, distribuidas en 331 géneros, 50 familias y 15 órdenes. Los principales taxones fueron Characiformes (42.6%), Siluriformes (34.8%), Gymnotiformes (8.6%) y Cichliformes (7.4%). Parte de la ictiofauna tiene distribución restricta para Loreto (4.7%). Además, 9.0% de las especies son usadas en pesquerías de Loreto. Mientras tanto, 219 (25%) especies fueron categorizadas de acuerdo con los criterios de la IUCN, donde sólo seis especies (0.7%) son consideradas actualmente especies amenazadas (CR, EN o VU). Los resultados presentados en este trabajo señalan que este departamento necesita más estudios para conocer la biodiversidad de peces, así mismo, la información presentada constituye un aporte al conocimiento de la biodiversidad íctica que respaldarían las acciones de gestión ambiental y toma de decisiones destinados a conservar uno de los departamentos más diversos del Perú.

Putative poison gland in the thorny catfish Acanthodoras spinosissimus (Siluriformes: Doradidae) / Suposta glândula de veneno no bagre rebeca Acanthodoras spinosissimus (Siluriformes: Doradidae)

Acanthodoras is the only genus of catfish known to secrete a conspicuous and abundant milky-looking substance through an axillary pore located just below the base of the posterior cleithral process. Despite this remarkable feature, there is no published information on the anatomical structures that produce the secretion and its possible biological/ecological functions. Dissection and histological analysis of preserved specimens of A. spinosissimus revealed the presence of a saccular axillary gland with large, binuclear secretory cells, similar to those found in other poisonous catfish. Secretory cells near the lumen appear to lose nuclei and become filled with secretory products, possibly with proteinaceous elements, as indicated by their eosinophilic appearance. As far as we know, the saccular morphology of the gland appears to constitute a unique characteristic of Acanthodoras among Doradidae catfishes. Further studies are necessary to determine the chemical composition of the secretion, as well as its possible uses by the catfish in its natural environment.

Acanthodoras é o único gênero de bagre conhecido por secretar uma substância de aparência leitosa conspícua e abundante através de um poro axilar localizado logo abaixo da base do processo cleitral posterior. Apesar dessa característica marcante, não há informações publicadas sobre as estruturas anatômicas que produzem a secreção, nem sobre suas possíveis funções biológicas/ecológicas. A dissecção e análise histológica de espécimes preservados de A. spinosissimus revelaram a presença de uma glândula axilar sacular com células secretoras binucleares, semelhantes às encontradas em outros bagres venenosos. As células secretoras próximas ao lúmen parecem perder os núcleos e são preenchidas com produtos secretores, possivelmente com elementos proteicos, conforme indicado por sua aparência eosinofílica. Até onde sabemos, a morfologia sacular da glândula parece constituir uma característica única de Acanthodoras entre os bagres Doradidae. Mais estudos são necessários para determinar a composição química da secreção, bem como seus possíveis usos pelo bagre em seu ambiente natural.

Putative poison gland in the thorny catfish Acanthodoras spinosissimus (Siluriformes: Doradidae)

ABSTRACT Acanthodoras is the only genus of catfish known to secrete a conspicuous and abundant milky-looking substance through an axillary pore located just below the base of the posterior cleithral process. Despite this remarkable feature, there is no published information on the anatomical structures that produce the secretion and its possible biological/ecological functions. Dissection and histological analysis of preserved specimens of A. spinosissimus revealed the presence of a saccular axillary gland with large, binuclear secretory cells, similar to those found in other poisonous catfish. Secretory cells near the lumen appear to lose nuclei and become filled with secretory products, possibly with proteinaceous elements, as indicated by their eosinophilic appearance. As far as we know, the saccular morphology of the gland appears to constitute a unique characteristic of Acanthodoras among Doradidae catfishes. Further studies are necessary to determine the chemical composition of the secretion, as well as its possible uses by the catfish in its natural environment.

RESUMO Acanthodoras é o único gênero de bagre conhecido por secretar uma substância de aparência leitosa conspícua e abundante através de um poro axilar localizado logo abaixo da base do processo cleitral posterior. Apesar dessa característica marcante, não há informações publicadas sobre as estruturas anatômicas que produzem a secreção, nem sobre suas possíveis funções biológicas/ecológicas. A dissecção e análise histológica de espécimes preservados de A. spinosissimus revelaram a presença de uma glândula axilar sacular com células secretoras binucleares, semelhantes às encontradas em outros bagres venenosos. As células secretoras próximas ao lúmen parecem perder os núcleos e são preenchidas com produtos secretores, possivelmente com elementos proteicos, conforme indicado por sua aparência eosinofílica. Até onde sabemos, a morfologia sacular da glândula parece constituir uma característica única de Acanthodoras entre os bagres Doradidae. Mais estudos são necessários para determinar a composição química da secreção, bem como seus possíveis usos pelo bagre em seu ambiente natural.

High prevalence and intensity of fish nematodes with zoonotic potential in the Brazilian Amazon, including a brief reflection on the absence of human infections

This study aimed to characterize the prevalence, mean abundance, and mean intensity of potential fish-borne zoonotic nematode larvae infecting the predator fish Hoplias aff. malabaricus from the Tapajós River, in the municipality of Santarém, in the Brazilian Amazon. After capture, the specimens of H. aff. malabaricus were analyzed for infection by Contracaecum sp. and Eustrongylides sp. third-stage larvae, and the prevalence, mean abundance, and mean intensity were calculated. A literature search was carried out to clarify the relationship between these indicators and eventual human cases of infection in the Amazon region. Third-stage larvae of nematodes of the Contracaecum and Eustrongylides genera were found in the specimens of H. aff. malabaricus sampled from the Tapajós River. The prevalence of Contracaecum larvae was 100%, while its mean abundance and mean intensity were both 54.8 larvae/fish. The prevalence of Eustrongylides larvae was 62.9%, and its mean abundance and mean intensity were 1.8 and 2.8 larvae/fish, respectively. Despite the high prevalence and intensity values, there are no cases of human infection by these nematode larvae in the Brazilian Amazon reported. The absence of human infections by these nematode larvae in the Brazilian Amazon despite the high prevalence/intensity of Contracaecum and Eustrongylides larvae and the high consumption of fish in the region, is most probably due to the fact that the local populations do not eat raw or undercooked fish. However, it is noteworthy that the absence of zoonotic cases in the region is based only on the examination of the available published papers. A better knowledge of the situation would require surveying hospitals and clinics, and data from the region's medical treatment facilities. However, the authors consider that cases of human infection, if any, are extremely rare, mainly due to the eating habits of the local population.

The distribution of Cteniloricaria (Siluriformes: Loricariidae): known and new records in Brazil suggest headwater captures as drivers of disjoint distribution

Cteniloricaria is a genus of Neotropical armored catfishes belonging to the Loricariinae, currently including two valid species: C. platystoma and C. napova. Cteniloricaria platystoma is presently recorded across the main coastal drainages of the Guiana Shield, from the Sinnamary River, French Guiana, to the Essequibo River basin, Guyana, and is considered to be restricted to the region. Cteniloricaria napova is only known from its type locality at the headwaters of the Paru de Oeste River, Amazon basin, Sipaliwini Savannah, Trio Amerindian territory in Suriname, close to the Brazilian border. Based on a specimen of C. napova, captured in the Cuminapanema River, a tributary to the Curuá River, within Brazilian territory, the geographic distribution of the species and the genus is extended, representing the first record of Cteniloricaria in Brazil. The genus shows a disjoint distribution, and divergence between populations in the north-flowing coastal rivers of the Guianas and the south-flowing Amazon tributaries, and more recent headwater capture between south-flowing Amazon tributaries, may have played a key role in shaping its current distribution. Illustrations, diagnostic characters, morphometrics, description of the habitat where the new specimen was captured, extinction risk assessment, and a discussion of the distribution of the genus are provided.(AU)

Cteniloricaria é um gênero de cascudos neotropicais pertencente à Loricariinae, atualmente incluindo duas espécies válidas: C. platystoma e C. napova. Atualmente, C. platystoma é registrada nas principais drenagens costeiras do Escudo das Guianas, desde o rio Sinnamary, na Guiana Francesa, até a bacia do rio Essequibo, Guyana, sendo considerada restrita à região. Cteniloricaria napova é conhecida unicamente por sua localidade-tipo nas cabeceiras do rio Paru de Oeste, bacia Amazônica, Savana Sipaliwini, território indígena de Trio, no Suriname, próximo à fronteira com o Brasil. Com base em um espécime de C. napova, capturado no rio Cuminapanema, afluente do rio Curuá, em território brasileiro, a distribuição geográfica da espécie e do gênero se estende até a bacia do rio Curuá, representando o primeiro registro de Cteniloricaria no Brasil. O gênero apresenta uma distribuição disjunta e, eventos como divergência entre as populações dos rios costeiros das Guianas e nos afluentes do Amazonas, e mais recente captura de cabeceiras entre os afluentes do Amazonas, podem ter desempenhado um papel fundamental em sua distribuição atual. São fornecidos ilustrações, caracteres diagnósticos, morfometria, descrição do habitat onde o novo espécime foi capturado, avaliação do risco de extinção e uma discussão sobre a distribuição do gênero.(AU)

Integrative taxonomy reveals disjunct distribution and first record of Hoplias misionera (Characiformes: Erythrinidae) in the Amazon River basin: morphological, DNA barcoding and cytogenetic considerations

The Hoplias malabaricus group encompasses six valid species and still is believed to harbors cryptic diversity. In this work, an integrative approach including morphological, DNA barcoding, and cytogenetic considerations was conducted to characterize a population of H. malabaricus from the Amazon basin that was recently allocated in the same mitochondrial lineage with H. misionera, a species originally described from La Plata basin. The DNA barcoding analysis revealed that the Amazon population nested together with H. misionera specimens from the La Plata basin (BIN AAB1732) in the same cluster. The intragroup distance (0.5%) was 12 times lower than the nearest neighbor (6%) distance. The morphometric analysis demonstrated slightly variation between Amazon and La Plata populations, being the former composed by larger specimens. Further morphological data supported the molecular evidence of H. misionera inhabiting Amazon basin. The karyotype characterization of H. misionera in the Amazon population showed 2n=40 and karyotypic formulae 20m+20sm, that added to C-banding, Ag-NOR and 18S results are suggestive of the similarity to karyomorph C of H. malabaricus. This work reveals the first record of H. misionera outside of La Plata basin and expands the species distribution for 2500 km northward until the Marajó Island, estuary of Amazonas River.(AU)

O grupo Hoplias malabaricus compreende seis espécies válidas e ainda acredita-se que abriga diversidade críptica. Neste trabalho, uma abordagem integrativa incluindo considerações morfológicas, de DNA barcoding e de citogenética foi conduzida para caracterizar uma população de H. malabaricus da bacia amazônica que foi recentemente alocada na mesma linhagem mitocondrial de H. misionera, uma espécie originalmente descrita para a bacia La Plata. A análise molecular por DNA barcoding revelou que essa população amazônica forma um clado monofilético com espécimes de H. misionera provenientes da bacia La Plata (BIN AAB1732). A distância genética intragrupo (0,5%) é 12 vezes menor do que para o vizinho mais próximo (6%). A comparação morfométrica demonstrou pequena variação entre as populações amazônica e La Plata, sendo os primeiros ligeiramente maiores. Entretanto, os dados morfológicos corroboram com evidência molecular e confirmam a ocorrência de H. misionera na bacia amazônica. A caracterização cariotípica de H. misionera na população amazônica apresentou 2n=40 e fórmula cariotípica 20m+20sm, que aliada aos resultados de banda C, Ag-NOR e 18S sugerem que seja similar ao cariomorfo C de H. malabaricus. Esse trabalho revela o primeiro registro de H. misionera fora da bacia La Plata e estende a distribuição da espécie por mais de 2500 km ao Norte, até a Ilha do Marajó, estuário do rio Amazonas.(AU)

Two new species of freshwater stingrays of the genus Paratrygon (Chondrichthyes: Potamotrygonidae) from the Orinoco basin, with comments on the taxonomy of Paratrygon aiereba

The genus Paratrygon, currently recognized as the sole monotypic genus of the family Potamotrygonidae, has a considerably greater diversity than previously indicated, including molecular studies, which supported P. aiereba (hitherto the only recognized species in the genus) as a possible species complex. Here we describe two new species of the genus that are both endemic to and sympatric in the Orinoco basin. Paratrygon aiereba, type species of the genus, is now restricted to the Amazon basin. Both new species are identified and defined through morphological characters such as coloration, dermal denticle morphology, arrangement of thorns, distribution and morphology of ventral lateral line canals, morphology of skeletal elements, and morphometrics. An extensive comparison of these characters between the new species herein described and P. aiereba is presented. Finally, a taxonomic reappraisal of P. aiereba is provided through a revision of preserved material and its original description, plus new evidence about its type-locatity, collectors, and a reconsideration of the destination of its type-specimen.(AU)

O gênero Paratrygon, reconhecido atualmente como o único gênero monotípico da família Potamotrygonidae, possui uma considerável alta diversidade do que previamente indicado, incluindo estudos moleculares, que corroboravam P. aiereba (a única espécie reconhecida para o gênero até então) como um possível complexo de espécies. Aqui descrevemos duas novas espécies do gênero para a bacia do Orinoco, ambas endêmicas e simpátricas para esta bacia. Paratrygon aiereba, espécie tipo do gênero, agora está restrita para a bacia Amazônica. Ambas novas espécies são identificadas e definidas através de caracteres morfológicos tais como coloração, morfologia dos dentículos dérmicos, arranjo dos espinhos pontiagudos, distribuição e morfologia dos canais ventrais da linha lateral, morfologia dos elementos do esqueleto e morfometria. Uma comparação extensiva destes caracteres entre as novas espécies aqui descritas e P. aiereba é apresentada. Finalmente uma reavaliação taxonômica de P. aiereba é fornecida através da revisão de espécimes preservados e de sua descrição original, além de novas evidências sobre sua possível localidade-tipo, coletores, e uma reconsideração do destino de seu espécime-tipo.(AU)

Rediscovering species: redescription of Bryconops gracilis (Characiformes: Iguanodectidae), an often-misidentified species

ABSTRACT A redescription of Bryconops gracilis is provided, a species poorly known for more than a century. Bryconops gracilis differs from all congeners by having the following combination of features: eight branched pelvic-fin rays, 31-36 anal-fin rays, 15-17 predorsal scales arranged in a regular series, two rows of premaxillary teeth, and 53-60 lateral-line scales. The species was often misidentified as B. alburnoides by sharing an overall elongated body shape, caudal fin yellowish in life, and a high number of lateral-line scales. A diagnosis between B. alburnoides and B. gracilis is provided. The holotype of B. gracilis which for many years had whereabouts unknown, was recovered, examined and illustrated by CT-Scan. Additionally, more detailed information about the type locality, morphology, color pattern (including in living specimens), habitat and distribution pattern of species are provided.

RESUMO A redescrição de Bryconops gracilis, uma espécie pouco conhecida por mais de um século, é fornecida. Bryconops gracilis difere de todas as congêneres por apresentar a seguinte combinação de caracteres: oito raios ramificados na nadadeira pélvica, 31-36 raios ramificados na nadadeira anal, 15-17 escamas pré-dorsais dispostas em uma série regular, duas séries de dentes no pré-maxilar e 53-60 escamas na linha lateral. A espécie foi frequentemente identificada erroneamente como B. alburnoides por compartilhar a forma geral do corpo alongada, nadadeira caudal amarelada em vida e um grande número de escamas na linha lateral. Uma diagnose entre B. alburnoides e B. gracilis é fornecida. O holótipo de B. gracilis que por muitos anos teve paradeiro desconhecido, foi recuperado, examinado e ilustrado através de CT-Scan. Adicionalmente, informações mais detalhadas sobre a localidade tipo, morfologia, padrão de coloração (incluindo em espécimes vivos), habitat e padrão de distribuição da espécie são fornecidas.

Hepatic coccidiosis in Serrasalmus rhombeus Linnaeus, 1766 from the Amazon basin: morphological and histopathological aspects / Coccidiose hepática em Serrasalmus rhombeus Linnaeus, 1766 da Amazônia paraense: aspectos morfológicos e histopatológicos

Abstract Calyptospora species are coccids that commonly cause liver infections in fish all around the world. This paper describes the morphology and histopathological characteristics of liver infection caused by Calyptospora sp. in black piranha Serrasalmus rhombeus, from the Capim River, in the municipality of Ipixuna do Pará, state of Pará (Brazil). Specimens were collected, analyzed and necropsied and tissue fragments containing parasites were prepared for histology and scanning electron microscopy. Parasitism was detected in 33.0% of the analyzed specimens, which had spherical oocysts in the liver, with four pyriform sporocysts presenting sporozoites internally. A histological examination revealed oocysts positioned close to blood vessels, causing necrosis and degeneration of hepatic parenchyma, while the presence of mononuclear cell infiltrate and melanomacrophages indicated the onset of an inflammatory process. This is the first record of the genus Calyptospora in fish from the Capim River.

Resumo Calyptosporídeos são coccídeos constantemente encontrados causando infecções hepáticas em peixes de todo o planeta. Este estudo descreve a morfologia e características histopatológicas da infecção hepática causada por Calyptospora sp. encontrados em Serrasalmus rhombeus, a piranha negra, oriunda do rio Capim, em Ipixuna do Pará, Brasil. Os animais foram coletados, analisados e necropsiados; fragmentos teciduais com a presença dos parasitos foram processados para histologia e microscopia eletrônica de varredura. O parasitismo ocorreu em 33,0% dos espécimes analisados, onde foram encontrados oocistos esféricos no fígado, com esporocistos piriformes, apresentando internamente esporozoítos. No exame histológico, os oocistos estavam dispostos próximos aos vasos sanguíneos, causando necrose e degeneração do parênquima hepático; a presença de infiltrado de células mononucleares e melanomacrófagos indicaram o início de um processo inflamatório. Este é o primeiro registro do gênero Calyptospora em peixes do rio Capim.

Stock assessment of the peacock bass Cichla temensis (Humboldt, 1821), an important fishing resource from the middle Negro river, Amazonas, Brazil / Avaliação de estoque do tucunaré Cichla temensis, um importante recurso pesqueiro do médio rio Negro, Amazonas, Brasil

Abstract Peacock bass Cichla temensis is an important species at the Amazon basin, since commercial, subsistence and recreational fisheries simultaneously exploit it. Cichla temensis is the preferred species by recreational fishers and it has been strongly exploited, mainly at the Negro river, the second largest tributary of the Amazon River. It was used data from experimental fisheries, collected at the middle stretch of Negro river, which were coupled with previously published data on its population dynamics, to run a yield per recruit model and build scenarios of sustainable fisheries. The results showed that the age of the first catch is a key variable to successful management of the peacock bass stocks at this region.

Resumo O tucunaré Cichla temensis é uma importante espécie de peixe da bacia Amazônica, uma vez que esta espécie é simultaneamente explotada pela pesca comercial e de subsistência. Além disso, é preferida pelos pescadores esportivos que atuam na região do rio Negro, o segundo maior afluente do rio Amazonas. Foram usados dados de pescarias experimentais, coletados no trecho médio do rio Negro. Estes dados foram vinculados a outros dados, previamente publicados, sobre sua dinâmica populacional, para executar um modelo de rendimento por recruta e, dessa forma, construir cenários para pesca sustentável dessa espécie. Os resultados mostraram que a idade da primeira captura é uma variável chave para gerenciar, com sucesso, os estoques de tucunarés nesta região.

Provenance of heavy and clay minerals in bottom sediments of Green Lake, an Amazonian fluvial lake in Brazil

Studies on provenance of minerals in Amazonian rivers focus mostly on suspended sediments, while processes that control bottom-sediment production and distribution are still little known. We determined the provenance of the bottom sediments of Green Lake, a micro-basin draining into the Tapajós River, in the eastern Brazilian Amazon. We used X-ray powder diffraction (XRD), Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR), scanning electron microscope (SEM) and, cathodoluminescence techniques to analyze clay, light and heavy minerals of 22 samples. The lake is L-shaped, with 5.5 m maximum depth, and predominance of mud over sand in the center. Quartz and feldspar were dominant in the light fraction, while zircon, tourmaline, kyanite, rutile, and staurolite were dominant in the heavy fraction. The clay fraction was dominated by kaolinite, with morphology and degree of crystallinity indicative of a detrital origin related to weathering. The Alter do Chão Formation (ACF) is suggested as the main source of sand sediments and heavy minerals, due to their mineralogical and percentage similarity. The provenance of kaolinite was mainly the ACF, with a minor contribution of the Amazon and Tapajós rivers. The primary origin of the heavy minerals in the ACF indicates the basement of the Amazonas Basin as source rock and this formation as a source of sediments for Green Lake through weathering and erosion processes under current tropical conditions. The presence of Aulacoseira granulata and Aulacoseira ambigua indicates the importance of current erosive processes on sediment production. (AU)

Redescription of Ancistrus greeni (Siluriformes: Loricariidae), and description of a new species from the río Madre de Dios basin, Peru

A new species of Ancistrus is described from minor tributaries of the río Madre de Dios basin (Cusco - Madre de Dios - Puno), in Peru. The new species shares with A. greeni an uncommon unicusp dentition; but it is distinguished from A. greeni by a larger orbital diameter, deeper caudal peduncle, and larger adipose-fin spine. The redescription of A. greeni is provided, and its recognition along with the discovery of this new species increases to five the officially number of Ancistrus species from the río Madre de Dios basin. The lectotype and paralectotype of A. greeni are provided.(AU)

Uma nova espécie de Ancistrus é descrita de pequenos tributários da bacia do rio Madre de Dios (Cusco - Madre de Dios - Puno), no Peru. A nova espécie compartilha com A. greeni uma dentição unicuspidada pouco comum e é diagnosticada de A. greeni pelo maior diâmetro orbital, maior altura do pedúnculo caudal e maior espinho da nadadeira adiposa. A redescrição de A. greeni é fornecida, e seu reconhecimento juntamente com a descoberta dessa nova espécie incrementam para cinco o número oficial de Ancistrus registradas para a bacia do rio Madre de Dios. O lectótipo e paralectótipo de A. greeni são fornecidos.(AU)

Checklist of the fishes from Jamari River basin, in areas under influence of dams, Rondônia, Brazil / Lista das espécies de peixes da bacia do rio Jamari, em áreas sob influência de reservatórios, Rondônia, Brasil

Abstract: The Madeira River is the most extensive tributary of the Amazon River and has the largest diversity of fishes in the world. On its right bank, the Madeira River receives the Jamari River, in which the first hydroelectric power plant (HPP) in State of Rondônia, Samuel HPP, was built. Besides this, other dams were built in the Jamari River and its tributaries, however, the available information in the scientific literature about the ichthyofaunistic diversity of this basin is rare. This work aims to provide an ichthyofaunistic inventory in a region of the Jamari river basin, in the State of Rondônia, where three small hydropower plants (SHPs) were implemented. The ichthyofauna was sampled in 16 expeditions between August 2015 and December 2018. Gill nets and seine nets were used with different meshes, as well as longlines and cast nets at different times of the day. Additionally, 81 INPA lots of species from the Samuel HPP area of influence were reanalyzed. Fish were identified according to the specialized literature, as well as in consultations with experts of various taxonomic groups. Voucher specimens of the species were cataloged and deposited in the ichthyological collection of the Núcleo de Pesquisas em Limnologia, Ictiologia e Aquicultura (Nupélia) of the Universidade Estadual de Maringá. A total of 230 species were recorded, of which 22 were putative new species, 117 were added to the Jamari River basin and 28 to the Madeira River basin. The continuation of the studies in this section of the Jamari river basin is fundamental for analysis of local impact due to the presence of dams. Moreover, the addition of putative new species to the Madeira River basin indicates gaps in the knowledge of Neotropical ichthyofauna.

Resumo: O rio Madeira é o mais extenso afluente do rio Amazonas e possui a maior biodiversidade de peixes do mundo. Em sua margem direita, o rio Madeira recebe o rio Jamari, no qual foi construída a primeira usina hidrelétrica (UHE) do estado de Rondônia, a UHE Samuel. Além desta, outros barramentos foram construídos no rio Jamari e em seus afluentes, contudo são raras as informações disponíveis na literatura científica sobre a diversidade ictiofaunística desta bacia. O objetivo deste trabalho foi providenciar um inventário ictiofaunístico na região da bacia do rio Jamari, no estado de Rondônia, onde foram implantadas três pequenas centrais hidrelétricas (PCHs). A ictiofauna foi amostrada em 16 expedições entre os meses de agosto de 2015 e dezembro de 2018. Foram utilizadas redes de espera e arrasto com malhas de diversos tamanhos, além de espinhéis e tarrafas em diferentes períodos do dia. Adicionalmente, 81 lotes de espécies do INPA da área de influência da UHE Samuel foram reanalisados. Os peixes foram identificados de acordo com a literatura especializada, bem como em consultas com especialistas de diversos grupos taxonômicos. Exemplares testemunho das espécies foram catalogados e depositados na coleção ictiológica do Núcleo de Pesquisas em Limnologia, Ictiologia e Aquicultura da Universidade Estadual de Maringá. Foram registradas 230 espécies, destas, 22 são possíveis espécies novas, 117 são acrescentadas à bacia do rio Jamari e 28 à bacia do rio Madeira. A continuação dos estudos neste trecho da bacia do rio Jamari é fundamental para análises de impacto local devido à presença de barramentos. Além disso, a adição de possíveis novas espécies à bacia do rio Madeira aponta lacunas no conhecimento da ictiofauna Neotropical.

Species richness and composition of snake assemblages in poorly accessible areas in the Brazilian Amazonia / Riqueza de espécies e composição de assembleias de serpentes em áreas pouco acessíveis na Amazônia Brasileira

Abstract: Snakes are a diverse group of terrestrial vertebrates of the order Squamata. Despite that, in the Amazonian biome, information about distribution and identification of snakes is limited when compared to other groups. Additionally, in Amazonia there is a sampling bias towards areas geographically close to urban centers and more densely populated areas. This in turn leads to false distribution gaps in poorly accessible areas of Amazonia. In this article we report the composition of snake assemblages in six areas of the Brazilian Amazonia, based on field sampling conducted over four years using standardized methods. We sampled 70 species from eight families: Typhlopidae (n=1), Leptotyphlopidae (n=1), Anillidae (n=1), Boidae (n=5), Colubridae (n=15), Dipsadidae (n=35), Elapidae (n=7), and Viperidae (n=5). The largest number of species was recorded in the Trombetas River area and the lowest in the Jatapu River area. The total beta diversity was 0.40 and the snake assemblages were structured mainly by replacement (72.5%). The time-limited search was the method that recorded the greatest number of individuals in the studied areas (44.1%) and also the greatest number of species (n=40). However, some species were recorded only by other methods such as interception by pitfall traps with directional fences. Despite the large number of species sampled in the study, no particular area comprised more than 40% of species registered in all the areas, indicating that snakes are poorly detected even with large sampling effort across multiple areas of a species distribution.

Resumo: Serpentes compõem um diverso grupo de animais vertebrados terrestres pertencentes à ordem Squamata. Apesar de serem um dos grupos mais diversos do mundo, na Amazônia, as informações acerca da taxonomia e distribuição de serpentes são limitadas quando comparadas com as disponíveis para outros grupos de vertebrados. Além disso, na Amazônia existe um viés de amostragem em áreas geograficamente próximas aos centros urbanos e locais densamente povoados. Isso por sua vez leva a falsas diferenças de distribuição em áreas pouco amostradas. Neste artigo nós apresentamos a composição de assembleias de serpentes em seis áreas na Amazônia brasileira, baseada em amostragens de campo padronizadas e realizadas durante quatro anos. Foram amostradas 70 espécies de oito famílias: Typhlopidae (n=1), Leptotyphlopidae (n=1), Anillidae (n=1), Boidae (n=5), Colubridae (n=15), Dipsadidae (n=35), Elapidae (n=7) e Viperidae (n=5). A maior riqueza foi registrada no Rio Trombetas e a menor no Rio Jatapu. A beta diversidade total foi de 0.40 e a substituição foi a principal força que estruturou as comunidades (72.5%). A Procura Visual Limitada por Tempo foi o método que registrou a maior abundância de serpentes nas áreas amostradas (44.1%) e também a maior riqueza (n=40). Entretanto, algumas espécies foram registradas somente por outros métodos como armadilhas de interceptação e queda. Apesar do grande número de espécies registradas, nenhuma das áreas compreendeu mais de 40% das espécies amostradas em todas as áreas, indicando que as serpentes são pouco detectadas mesmo com grande esforço amostral em diferentes áreas da distribuição das espécies.

Clave taxonómica de ninfas de Ephemeroptera(Insecta) del sudeste de Perú / Taxonomic key of nymphs of Ephemeroptera (Insecta) from southeastern Peru

Ephemeroptera es un orden de insectos cuyas etapas inmaduras cumplen un importante papel ecológico en los ecosistemas acuáticos. Sin embargo, el conocimiento de su diversidad en áreas tropicales aún es escaso. Específicamente, en el Perú se han reportado 64 especies pertenecientes a 35 géneros y ocho familias. En este estudio se presenta una clave taxonómica para la determinación de géneros de ninfas de Ephemeroptera de la vertiente suroriental de los Andes del Perú. Las ninfas revisadas fueron recolectadas en las quebradas de los departamentos de Cusco y Madre de Dios, dentro de un gradiente altitudinal de 180 - 4411 m, en los años 2012, 2013, 2015 y 2017. Se utilizaron tres metodologías de muestreo: recolección manual, red Surber y colonización de paquetes de hojas. Se reconocieron 48 géneros de ocho familias en 36 quebradas dentro de este gradiente. Seis géneros son nuevos registros para el Perú: Prebaetodes, Zelusia, Meridialaris, Tricorythopsis, Homoeoneuria y Hubbardipes.

Ephemeroptera is an insect order of whose immature stages play an important ecological role in aquatic ecosystems. However, its diversity knowledge in tropical areas is scarce. In particular, only 64 species of 35 genera and eight families have been reported in Peru. In this work, we provide a general key of Ephemeroptera nymphs for southeastern Peru. Nymphs were collected from streams of Cusco and Madre de Dios departments, within an altitudinal gradient of 180 - 4411 m, in 2012, 2013, 2015 and 2017 years. The samples were obtained by manual collection, using a Surber net and by colonization of leaf packs. We recognized 48 genera within eight families, coming from 36 streams within the gradient. Six genera are new records to Peru: Prebaetodes, Zelusia, Meridialaris, Tricorythopsis, Homoeoneuria and Hubbardipes.

New record of the fringed leaf frog, Cruziohyla craspedopus (Anura: Phyllomedusidae) extends its eastern range limit

The fringed leaf frog, Cruziohyla craspedopus is rarely sampled in the Brazilian Amazon, probably due to low detection probability associated with its arboreal habit. The knowledge about the species' distribution stems from successive additions of occasional occurrence records, which indicate that the species is widely distributed throughout Amazonia. We present new occurrence records to update the geographic range of the species, which is hereby extended 224 km to the northeast. We also present morphological data from collected specimens and discuss the updated range from the geographic and ecological points of view. We show that the range of the leaf frog crosses several main tributaries along the southern bank of the Amazonas River, although the species occurrence is apparently limited by a minimum tree cover of 70%. (AU)

Population and reproductive parameters of the red-tailed catfish, Phractocephalus hemioliopterus (Pimelodidae: Siluriformes), from the Xingu River, Brazil

A field study of the sex ratio, length-weight ratio, body size at first gonadal maturation, and the breeding season of the red-tailed catfish, Phractocephalus hemioliopterus, was carried out in the region of the middle Xingu River in the eastern Amazon basin. The fish were sampled quarterly from September 2012 to January 2014 using gillnets and long lines. The sex ratio was balanced, and while males and females were similar in standard length, the females were heavier than the males, on average. The males presented negative allometric growth, and the females, isometric growth. The estimated size at first maturity was 77.8 cm. The variation in the gonadosomatic index and the greater frequencies of mature specimens indicated a reproductive peak at the beginning of the high-water (flood) period. As P. hemioliopterus is an important commercial fish, our findings will contribute to the future development of effective conservation and management strategies, such as minimum catch size and a close season that is appropriate for the region. These data will also provide important insights for the evaluation of potential impacts on the biology of this fish resulting from the construction of Belo Monte dam.(AU)

Um estudo de campo sobre a proporção sexual, relação peso-comprimento, tamanho de primeira maturação gonadal e o período reprodutivo da pirarara, Phractocephalus hemioliopterus foi realizado na região do Médio Rio Xingu, na Amazônia oriental. Os espécimes foram coletados trimestralmente entre setembro de 2012 e janeiro de 2014, utilizando redes malhadeiras e espinheis. A proporção sexual foi balanceada, e machos e fêmeas foram equivalentes quanto ao comprimento padrão, mas fêmeas foram mais pesadas do que machos. Crescimento alométrico negativo foi evidenciado para machos e crescimento isométrico para fêmeas. O tamanho estimado de primeira maturação sexual foi igual a 77,8 cm. A variação do índice gonadossomático e a maior frequência de indivíduos maduros evidenciaram uma maior atividade reprodutiva no começo do período de águas altas (enchente). Considerando P. hemioliopterus como uma espécie de interesse comercial, as informações aqui apresentadas poderão ser uteis para um futuro plano de conservação e manejo como o estabelecimento de um tamanho mínimo de captura e período de defeso para a região. Além disso, poderá ser útil para avaliar potenciais impactos na biologia dos peixes em decorrência das mudanças ambientais provocadas pela construção da barragem de Belo Monte.(AU)